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SNP分型

 SNP介紹：

單核苷酸多態(tài)性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），即指由于單個(gè)核苷酸堿基的改變而導(dǎo)致的核酸序列的多態(tài)性。在不同個(gè)體的同一條染色體或同一位點(diǎn)的核苷酸序列中，絕大多數(shù)核苷酸序列一致而只有一個(gè)堿基不同的現(xiàn)象，這就是SNP。由于SNP在人類基因組中數(shù)量較多，發(fā)生頻率較高，因此被認(rèn)為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳學(xué)標(biāo)記，在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)、藥物遺傳學(xué)、疾病遺傳學(xué)、疾病診斷學(xué)、以及人類進(jìn)化等研究領(lǐng)域都有著很高的研究價(jià)值和應(yīng)用前景。
上海邃志生物科技在SNP位點(diǎn)分析和研究方面積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)，擁有開展SNP研究的先進(jìn)儀器設(shè)備，具有自己獨(dú)到的研究策略和方法，并且已經(jīng)建立大樣本量人群的SNP基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫，能通過這些資源的有效挖掘，更好地幫助客戶開展SNP方面的研究工作，包括SNP的功能學(xué)研究。

SNP檢測(cè)技術(shù)介紹及比較：

質(zhì)譜分析法（mass spectrometry）
該方法利用質(zhì)譜分析對(duì)質(zhì)量的靈敏度特別高的特點(diǎn),很容易將僅含有一個(gè)不同堿基的兩段基因序列區(qū)別開的特點(diǎn),使用質(zhì)譜直接或間接檢測(cè)等位基因特異性延伸區(qū)的反應(yīng)產(chǎn)物,推導(dǎo)出SNP。單堿基延伸或其修飾形式與基質(zhì)輔助激光吸收/離子飛行時(shí)間(MALDI-TOF)質(zhì)譜結(jié)合已被廣泛的應(yīng)用,并已被美國公司(Agena)發(fā)展為商業(yè)性產(chǎn)品。我公司提供的SNP檢測(cè)技術(shù)服務(wù)，就是基于這樣的方法。

DNA芯片技術(shù)（DNA chip） 
將已知序列的寡核苷酸DNA排列在1塊集成電路板上，將熒光標(biāo)記的正常DNA和突變DNA發(fā)別與2塊DNA芯片雜交，由于至少存在1個(gè)堿基的差異，正常和突變的DNA將會(huì)得到不同的雜交圖譜，經(jīng)過共聚集顯微鏡檢測(cè)兩種DNA分子產(chǎn)生的熒光信號(hào)，確定是否存在突變。

限制性片段長度多態(tài)性分析法(RFLP)
RFLP技術(shù)利用限制性核酸內(nèi)切酶識(shí)別并剪切特定DNA序列的能力,檢測(cè)基因片段上限制性核酸內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)處是否存在核苷酸突變。應(yīng)用限制性內(nèi)切酶對(duì)兩個(gè)等位基因識(shí)別的差異,產(chǎn)生不同大小的切割片段,通過電泳遷移率的不同來判定是否存在SNP。

實(shí)時(shí)熒光PCR分析法
使用針對(duì)核酸中不同多態(tài)性序列的熒光Taqman探針，它們?cè)?/span>PCR擴(kuò)增中被水解釋放熒光信號(hào)，只有與靶序列完全匹配的探針才能被相應(yīng)的切割。不同探針標(biāo)記不同的熒光報(bào)道信號(hào)。利用多通道熒光PCR儀檢測(cè)結(jié)果，可以便捷判斷核酸多態(tài)性。

單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析法（SSCP）
在非變性聚丙烯酰胺凝膠上，短的單鏈DNA和RNA分子依其大堿基序列不同而形成不同構(gòu)象，一個(gè)堿基的改變將影響其構(gòu)象而導(dǎo)致其在凝膠上的移動(dòng)速度改變。

DNA測(cè)序法（DNA sequencing）
雙脫氧終止法，引物用四種不同前顏色的熒光標(biāo)記，使每個(gè)樣品的四個(gè)測(cè)序反應(yīng)可在一個(gè)反應(yīng)管和一個(gè)泳道內(nèi)進(jìn)行。